1. 开发出基于 WES 和 RNAseq 检测 RNA 全局编辑软件(python/R): 负责项目立项、调研、代码实现、测试优化及上线运行,填补此类分析空缺.
2. 开发出适用于公司技术平台的基于扩增子测序检测 RNA 编辑效率软件(python/R) : 负责项目立项、调研、代码实现、测试优化及上线运行,能够准确快速的完成大批量数据分析需求.
3. 开发出基于 Sanger 测序检测 DNA 编辑线上可视化分析工具(Django+SQLite+JS+html+Plotly):负责调研、代码实现、测试优化及线上运行,解决了公用软件存在的数据安全、版本控制、编码格式等常见问题.
4. 开发出基于扩增子测序高精度检测 RNA Exon-skiping 软件(python) :负责项目立项、调研、reporter 测序数据收集、代码实现、测试优化及上线运行.
5. 开发出高性能 RNA 编辑全局脱靶定量软件(python+java+C++) :负责项目立项、调研、代码实现及线上运行,可有效评估 RNA 编辑全局脱靶.
6. 开发出高性能疾病数据库(Django+PostgreSQL+bootstrap+JS+html) :开发了遗传病相关数据库辅助筛选新的编辑靶点,负责项目立项、调研、数据采集、格式化、前后端搭建;开发了癌症相关药物处理细胞系、动物模型数据库辅助特定药物响应 biomark 筛选,负责内、外部数据收集、变异检测、功能注释、线上交互查询式数据库构建.
7. 建立了蛋白 3D 结构预测体系(python/C++):根据已有 alphafold2、rosettafold 等 deeplearning 算法实现了蛋白 3D 结构的自主预测、评估,推动体内治疗 ASO 类药物研发.
8. 基于机器学习模型建立了 RNA 编辑系统 arRNA 脱靶偏好模型(python) :根据 RNA 编辑和二级结构数据构建 RNA 编辑脱靶偏好模型,辅助 RNA 编辑项目 arRNA 设计.