负责遗传病辅助诊断相关算法开发

负责三个部门的技术团队组建，从零搭建三个技术团队，组织开展各类研发工作。
负责公司生信云平台和一体机产品的研发，完成了技术选型，原型设计，开发出了MVP，打通了所有技术环节并在一个1000例WGS样本的GWAS项目中进行了应用，稳定地完成了二级分析中大量的计算任务。
负责集团与Illumina合作的肿瘤基因组检测产品研发项目的生信平台/分析流程/报告解读系统/知识库构建工作。学习并掌握了Illumina本地分析流程以及DRAGEN分析的使用方法，完成了前期内部测试数据的分析任务。独立开发了知识库注释程序，用于将内部知识库的内容注释到检测结果中。带领解读团队配合知识库开发工作，从零构建了肿瘤知识库的一个基础版本，可以用于出具多种实体瘤报告。

负责生物信息部日常工作管理、团队建设、OKR设置与绩效考核。与公司一起学习和实践OKR在日常部门管理中的应用，为公司设计了新的生信部考核方法，完成了人才评估和发展路线设计。
负责WES、CNVSeq等多个产品线涉及的开源算法评估测试、优化及错误修正。对公司一款CNV检测产品的算法进行修正，大幅改善了最终结果的准确性。对WES分析流程进行了优化，个别环节分析时间减少了50%。
负责各类产品线中基于Cromwell与高性能计算集群的自动化生信分析流程构建。使用WDL和cromwell重新构建了公司WES检测产品的分析流程，并确保生信分析结果的一致性。
负责新产品研发相关生信数据分析、评测、算法开发及流程构建。
负责解决日常生产中遇到及各类客户提出的生信技术问题。

所在部门：研发中心
工作地点：黑龙江
下属人数：20
汇报对象：CEO
职责业绩：
管理~20人团队，进行多种生信数据分析自动化流程开发 WGS WES RNA-seq ScRNA-seq 16S Metagenomics
各类变异检测（SNV Indel SV CNV Fusion）算法调研、测试与集成
测序数据样本管理系统开发，分析流程可视化程序开发
生信技术团队建设，对团队数据分析与程序设计工作进行指导与考核
跟进领域前沿成果，并在团队内进行讲解与分享。

Research Fellow The Centre for Computational Medicine Toronto, Canada
基于RNA-SEQ测序数据的基因融合检测工作流开发
基于全基因组测序（WGS）数据的单碱基变异（SNV）、结构变异（SV）与拷贝数变异（CNV）检测工作流开发
弥漫性脑桥神经胶质瘤（DIPG）肿瘤及对照正常样本的基因融合检测与分析 RNA-SEQ, WGS;样本规模: 50-100
低级别胶质瘤(LGG)肿瘤样本的基因融合检测与分析 RNA-SEQ;样本规模: 50-100
急性骨髓性白血病（AML）肿瘤样本的基因融合检测与分析 RNA-SEQ;样本规模: 50-100
炎症性肠病（IBD）个体及家系样本的单碱基变异检测与分析 WES；样本规模2500-3000

Gene fusion analysis of Tumor samples